O sequenciamento shotgun é o método usado pelo projeto genoma privado. O sequenciamento shotgun requer múltiplas cópias do genoma, que são efetivamente explodidas em milhões de pequenos fragmentos. É realizada como uma grande fita de DNA e é quebrada em pequenos fragmentos, e eles são remontados de acordo com suas sobreposições. Então o clone completo de DNA é formado.
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